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三代小基因組測序
細菌、病毒甚至癌細胞通暢存在于與變異密切相關的復雜群體中。這些變異會響應環境變化,例如免疫壓力或藥物治療造成的快速進化。使用二代測序對復雜群體進行鑒定需要復雜的組裝算法,使得混合群體中相關度非常高的個體的區分變得非常困難。Sequel系統可從病毒種群的鑒定、微生物群落的鑒定和體細胞變異的檢測三個方面對復雜種群進行鑒定。
葉綠體基因組和線粒體基因組序列都包含重復序列、反向重復序列等復雜結構,PacBio Sequel的長讀長可直接跨越這些區域獲得這些細胞器的全基因組序列信息等,基因組組裝不依賴于是否有近緣物種的線粒體和葉綠體基因組信息等、重測序能夠檢測到多方面的SNPs及InDel信息。
技術流程

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技術路線

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建庫流程

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分析流程
分析內容
細菌De novo測序
細菌基因組研究,是通過基因組測序和組裝獲得細菌全基因組序列,并對其進行結構和功能研究的方法。依據研究目標所需精細程度的不同,我們可進行細菌框架圖、精細圖和完成圖的構建。三代測序能夠克服基因組中重復區域和高GC區域組裝難題,可以拿到無N堿基、無Gap的細菌基因組完成圖。

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真菌De novo測序
真菌基因組研究,是通過基因組測序和組裝獲得真菌全基因組序列,并對其進行結構和功能研究的方法。真菌De novo測序具有真菌框架圖、精細圖和作為真菌精細圖前置的真菌Survey三種不同精細程度的解決方案,滿足不同的研究需求。

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小基因組測序
利用單分子實時測序技術可以獲得線粒體/葉綠體基因組、病毒基因組、質粒、BAC/Fosmid/YAC等小基因組的完成圖,平均讀長10 kb左右,組裝結果無N堿基、無Gap。

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