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iTRAQ/TMT標記定量蛋白質組

iTRAQ和TMT是目前運用較為廣泛的兩種標記定量蛋白質組技術,通過與肽段N末端基團結合(還可以與賴氨酸側鏈氨基進行結合。除了這兩個結合位點,TMT不同類型試劑還有多種結合位點),實現對多肽的標記,并通過不同分子量的試劑對不同來源樣品進行標記的方式實現不同樣品間蛋白質組比較的目標,結合報告離子的峰面積計算同一蛋白質同一肽段在不同樣品間的比值,從而實現蛋白的定量比較。

技術流程

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服務優勢

定量準確:可以檢測至少百分之五的差異
重復性好:相比雙向電泳等技術具有更好的重復性
數據豐富:分離出的蛋白都有定性和定量信息
通  量  高:iTRAQ可以同時進行8個不同樣品的分離分析(TMT上限為10個)
分辨率高:一次實驗可實現幾千個蛋白的分析并對低豐度蛋白有較強的檢測能力

案例展示

案例一  顯微切割組織的比較蛋白組分析發現膀胱癌的新分子標志物

實驗材料
四例膀胱癌樣品及癌旁組織
研究結論
發現癌組織中包括有機物響應、無機金屬離子響應、無機物響應在內的多個生物學過程中對應的蛋白出現顯著上調。
腫瘤細胞中三個蛋白SLC3A2、STMN1和TAGLN2的含量嚴重超標,并預示著TAGLN2很有可能是一個有效的腫瘤組織診斷標志物,可用于評估膀胱癌患者的淋巴結轉移情況 (AUC=0.999)。

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參考文獻

Chen C. et al., Comparative tissue proteomics of microdissected specimens reveals novel candidate biomarkers of bladder cancer. 2015, Mol. Cell. Proteomics.


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