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當前位置:中国福彩网下载 » 搭乘單細胞測序快速列車,推動生命科學快速發展

前 言

單細胞測序技術雖然已有近10年的發展歷史了,至今也有接近2000篇文章發表,但與其應用潛力相比,還遠遠不夠。其原因除了認知等方面外,主要是前期的單細胞測序費用昂貴,一個細胞需要數千至上萬元,而一個項目至少測上千個細胞。高昂的費用大大限制了其應用。

近年來,隨著10× Genomics等單細胞測序技術的發展,大大降低了實驗成本,每個細胞的實驗費用已經降到了10元左右。另外,分析方法也逐步發展成熟。一個項目投入一二十萬,就可能在很短的時間內得到有意義的結果了。因此,當前限制單細胞測序技術應用,已經不是費用的問題了。能不能搶在競爭對手前面開展項目,盡快發表文章,就看對技術的認知和行動了。

單細胞測序的重大意義

認知是行動的先導。

回顧單細胞測序的重要意義,明確其在整個生命科學技術發展上的歷史地位,對于大部分科研人員還是很有必要的。

早在2013年,單細胞測序技術被Nature Methods評為年度技術(圖1左)。同年,《科學》雜志(Science)將單細胞測序列為年度最值得關注的六大領域榜首,認為該技術將改變生物界和醫學界的許多領域。由于單細胞測序技術廣闊的應用前景,2015年單細胞測序技術再度登上Science 轉化醫學封面(圖1右)。

 

《Nature Method》雜志為單細胞測序做了高度評價:

“Every cell is unique—it occupies an exclusive position in space, carries distinct errors in its copied genome and is subject to programmed and induced changes in gene expression. Yet most DNA and RNA sequencing is performed on tissue samples or cell populations, in which biological differences between cells can be obscured by averaging or mistaken for technical noise.”

 

基因測序技術的發展推動了人類基因組計劃(HGP)的發展,

單細胞測序技術的發展,則推動了計劃耗資30億美金的“人類細胞圖譜計劃”的誕生。

(//www.biotech.org.cn/information/150230)

 

把單細胞測序和近年來的一些研究熱點或技術做一比較分析,可以更深刻地理解其獨特價值。近年來,分子生物學的研究獲得了廣泛的進展,如各類非編碼RNA研究如火如荼,高通量測序、 Crispr技術的應用等。細胞生物學則在干細胞及IPS等方面獲得的很多進展。單細胞測序技術則讓科研人員可以在組織水平不同類型多細胞間的相互關系做更深一步、更系統的研究和了解。這對于理解生命現象,研究發病機制非常重要。因為,細胞是生命活動的基本單位。因此可以說,單細胞測序技術為科研人員提供了一個新的緯度,新的視角來研究生命現象。

 

單細胞RNA測序的分析內容

單細胞RNA測序是應用最廣泛的單細胞測序技術。傳統的RNA測序(bulk RNA-seq)分析內容,單細胞RNA測序都可以分析。單細胞測序分析的重點是異質性部分的分析。主要包括Marker基因分析,細胞分群及細胞類型鑒定,擬時序分析,基因相關性分析等。這些分析都有很多潛在的價值,比如發現新的Marker基因;發現新的細胞類型;根據擬時序分析,分析細胞分化軌跡;根據基因相關性分析,分析基因調控網絡等。

 

單細胞測序應用領域

單細胞測序的應用領域非常廣泛。既可以用于動物,也可以用于植物和微生物。尤其在免疫,發育,腫瘤,神經等領域有巨大潛力。

就腫瘤而言,不但可以研究腫瘤異質性,還可以研究腫瘤微環境。

 

結 語

歐易生物已完成多個單細胞測序項目,積累了豐富的樣品制備和數據分析經驗。歐易生物愿秉承一貫的“硬數據,好服務”的理念,期待與您攜手,借助單細胞測序技術,共同推動生物及醫學領域的新進展!

 

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財哥 撰文

本文系歐易生物原創

轉載請注明本文轉自歐易生物 

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